第五十一代：孔文遠、孔元措（1181-1250）、孔元用

   孔文遠，字紹先，孔子第五十一代嫡孫。孔文遠于宋光宗紹熙四年（1193）襲爵，曾官至隆興府倅（佐二副官，通判），秩滿授朝奉郎（正七品）。卒于宋理宗寶慶二年（1226），葬衢州。孔文遠一子，孔萬春。

   孔元措，字夢得。其父孔摠因病去世時，孔元措年僅十歲。次年（1191），金章宗明昌二年（1191）四月，十一歲的孔元措補授文林郎，襲封衍聖公，主林廟祀事。金代初期的衍聖公爵高品低，階文林郎，秩僅正八品，所以金章宗又特詔衍聖公孔元措中議大夫，正三品上，賜四品階勳封，且「以後襲封，並准此例」。對於這段故實，《金史·孔璠傳》也有記載：「元措字夢得。三年四月詔曰：衍聖公視四品，階止八品，不稱。可超遷中議大夫，永著於令。」

   金章宗明昌元年（1190）春三月詔修闕裡孔子廟，五月又詔諸郡邑孔子廟隳廢者一律修復。孔元措繼續了其父孔摠修葺祖廟的志業，奉詔修廟。金帝撥錢七萬六千四百多緡，命幹臣領其役，大修闕裡聖廟，於明昌二年春興工，至明昌五年（1194）秋告竣。這次修繕，是繼宋天禧二年之後，闕裡孔廟的再次大規模擴建，後世的廟制形態初步具備。金代從熙宗皇統二年（1142）至章宗明昌五年（1194）的五十余年間，修闕裡孔廟凡八次，此時的闕裡孔廟基本保持了宋代的格局，但部分建築規模卻進行了擴建，新建大中門、欞星門，且始用琉璃瓦，殿廡均以綠琉璃瓦剪邊，青綠彩畫，朱漆欄檻，簷柱也改為石質，並雕龍為飾，使闕裡廟制大為提高。但可惜的是，這一耗費巨大人力物力的工程，卻在不久南下的蒙古兵鐵蹄下，廟貌又複殘毀，率多化為灰燼。

   承安元年（1196）冬十一月，金章宗行郊祀禮，召孔元措赴闕侍祠，位在終獻之次。二年（1197）正月，孔元措年滿十七歲，詔令衍聖公兼曲阜縣令。五年（1200），又給孔元措擢升一階的獎勵。泰和元年（1201）金章宗又撥給衍聖公祭田六十四畝，以供祀事。金宣宗完顏珣貞佑二年（1214）正月紅襖軍攻佔闕裡，火燒孔子廟。同年五月蒙古南侵，金帝遷都南京（今河南開封），詔孔元措赴汴京行在。但此時孔元措適逢母喪，遂於貞佑三年七月起複，遙授東平府（今山東東平）通判，詔令以來年春天再行赴任。十月，金帝又聽從高琪之議，因曲阜一代時局動盪，為保護聖裔，令孔元措隨朝任職，改授為太常博士。孔元措離開曲阜後，林廟奉祀之事暫交由其族兄孔元用代攝。

   金宣宗興定四年（1220）七月，晉孔元措為太常丞。元光元年（1222）十一月，又授同知集賢院兼行太常丞事。金哀宗完顏守緒正大二年（1225）三月，再授知集賢院兼行太常丞。四年，秩滿複任。金哀宗天興元年（1232），改授孔元措泰定軍節度使、兗州管內觀察使、兼行太常少卿。二年正月，遷光祿大夫，晉太常卿。太常卿，為九卿之一，從二品上，文散官第七階。元太宗窩闊台五年（1233），蒙古伐金，佔領汴京，元太宗命孔元措還東平，仍襲封衍聖公，主奉祀事。逾年，金亡。元太宗十年（1238）十一月，孔元措上書窩闊台請求收錄禮樂之舊：「兵興以來，禮樂散失，燕京、南京等處，亡金太常故臣及禮冊樂器多有存者，乞降旨收錄。」元帝准其所奏，命各處管民官如有亡金知禮樂舊人，可並其家屬徙東平，令孔元措統領，于本路稅課所給其食。元太宗十一年（1239）孔元措奉詔赴燕京，得到金帝時候的掌樂許政、掌禮王節、和樂工翟剛等九十二人並帶回曲阜，在闕裡祖庭演習登歌樂。後來又在東平造樂器、制冠冕法服、鐘磬筍虡儀物。禮樂肄習既成後，孔元措于元憲宗二年（1252）帶領樂人遠赴漠北日月山，奏于元帝蒙哥之前，遂用以祭祀昊天上帝。從此，有元一代才開始有了較為完整而又正規的禮樂制度，是以「元朝一代禮樂，公實始創之。」（《闕裡文獻考》）

   元太宗窩闊台五年（1233）冬十一月，曾敕修孔子廟，九年（1237）詔令衍聖公孔元措再修闕裡孔子廟，並給複守廟一百戶，但這次維修工程很小，僅僅「複建寢殿，暫寓先聖及十哲像」而已。乃馬真後三年（1244），孔元措又主持重修了至聖林思堂，並首立宣聖王、紈褲子弟、三世祖、聖考齊國公等墓碑。

   孔元措對孔氏家族的另一大貢獻是撰成《孔氏祖庭廣記》一書。是書依據孔子第四十六代孫孔宗翰所撰《家譜》和孔子第四十七代孫孔傳的《祖庭雜記》合二為一，並纂集增補而來。孔傳的《祖庭雜記》之版亡于宋金之亂，孔傳遂後來在撫州任上重新編纂了《東家雜記》二卷，《祖庭雜記》的部分內容則實際收錄于孔元措《孔氏祖庭廣記》之中。《孔氏祖庭廣記》卷首為圖本，分孔子像、尼山防山魯國圖等，以下各卷分先聖、追崇聖號、世次、崇奉詔文、崇奉雜事、林廟親祠、學廟親祠、祭祀雜事、族孫、世系別錄等門類，凡林廟內外之古跡、古碑、廟宅等均有涉及，計十二卷二十六門八百四十條，被視為一部重要的孔氏志書。

   海迷失後二年（1250）、即宋理宗淳佑十年，孔元措卒，享年七十歲，葬于祖墓之西。因其沒有子嗣，以其弟元紘之孫孔湞襲爵。

   孔元用，字俊卿。為孔宗願第三子若愚之後，為衍聖公孔元措之族兄。金宣宗貞佑三年（1215）孔元措被召赴汴京，孔元用受囑暫攝闕裡林廟祀事。興定四年（1220）蒙古太師木華黎經略山東，曾頒給孔元用衍聖公兼曲阜縣印信。元光元年（1222），宋軍收復京東西路，曲阜縣複歸於宋。宋甯宗嘉定十七年（1224）授孔元用通直郎，理宗寶慶元年（1225）孔元用任仙源縣令。但旋即蒙古兵又取京東西路，曲阜縣又入於蒙古。蒙古太祖二十一年（1226），郡王帶孫征李全攻益都（今山東青州），以孔元用有將略，命其帶兵隨征，孔元用以其子孔之全主祀事兼曲阜縣尹。次年（1227），孔元用卒於益都城下，年五十三歲，葬于祖墓西北。子一，孔之全。

第五十二代：孔萬春、孔之全

   孔萬春，字耆年，孔子第五十二代嫡孫。孔萬春于宋理宗寶慶二年（1226）五月壬寅，授承奉郎、襲封為衍聖公，專主衢州家廟祀事。寶慶三年（1227）宋理宗又任命孔萬春為衢州府通判，但不必至衙署視事，仍以主鬯孔子祀事為其主要職責。孔萬春階至奉議郎，官終泉州府通判兼南外宗正丞，卸任後於淳佑元年（1241）去世於衢州，葬衢州祖塋。至此，孔氏南宗寓居衢州，已相曆四十八代孔端友、四十九代孔玠、五十代孔搢、五十一代孔文遠、五十二代孔萬春五代衍聖公。此時的南宗以衢州為中心，也得到發展壯大，宋廷更啟用了諸多孔氏族人。當年隨孔端友南渡的族人，除孔端友從父孔傳外，還有孔傳次子端己、四子端植、五子端隱，孔若愚長子端弼諸多族人。孔傳官至中散大夫，端植官封湖廣通城令，端隱為江陵府推官，端弼至大理寺評事，端思為杭州府教授。

   孔萬春一子，孔洙。

   孔之全，字工叔，孔元用之子。金貞佑三年（1214）孔元措被召赴汴京隨朝任職，曲阜林廟祀事便委託給孔之全之父孔元用代攝，蒙古太祖二十一年（1226）孔元用被征攻益都，孔之全則被封為權襲衍聖公兼曲阜縣尹。元太宗五年（1233），窩闊台令孔元措自汴京還東平，仍襲封衍聖公。但如此一來，非但南宗衢州，即便闕裡祖庭也出現了兩個衍聖公。《元贈中議大夫襲封衍聖公孔公（今按，即孔治）神道碑》記載了孔元措和孔之全同見東平路行軍萬戶嚴實的故事：「金已前襲封元措來歸，同謁武惠嚴侯。公因讓曰：『以賢以長，責在吾叔。』元措乃許曰：『子父子保全林廟，當世其邑。』武惠允之，仍居邑宰二十餘年。」孔元措讓出曲阜縣尹後，此後的衍聖公就不再兼任曲阜縣尹，曲阜縣一職則一直到明初都在孔之全一系中傳襲。孔之全年五十一而卒。子三：孔治、孔澄、孔濟。

第五十三代：孔洙（1231-1291）、孔湞、孔治（1237-1307）

   孔洙，字景清，孔子第五十三代嫡孫。孔洙在其父孔萬春去世後，以宋承奉郎身份襲爵嗣封，奉孔子祀。在任期間，經衢州知州孫子秀所請，正式營建了衢州孔氏家廟。宋理宗寶佑元年（1253），衢州知州孫子秀上書宋廷，建言正式營建衢州家廟。理宗准其所請，撥官錢三十六萬緡，仿闕裡祖廟之制，於衢州城東北菱湖南岸新建南宗孔廟專祠。宋廷在衢州建南宗家廟後，又對孔氏南宗多次賜祭田、免租稅，以優禮聖裔，但此廟毀于宋末戰火。孔端友時期，宋高宗在紹興六年僅是以衢州學廟權作孔氏家廟而已，至此，孔氏南宗方始建家廟。然世事陵夷，南宋祥興二年（1279）、即元至元十六年二月，陸秀夫負幼帝投海而死，宋祚乃亡，元世祖忽必烈也隨之統馭中國。而此時的北宗，則由於孔湞被奪爵，一直處於世爵中斷的狀態，僅由孔子第五十三世孫、曲阜縣尹孔治暫時代攝林廟祀事。至元十七年（1280），詳議官王惲向元世祖忽必烈上疏《立襲封衍聖公事狀》，忽必烈令議孔氏當立者，經過廷議，認為「以端友之孫孔洙當襲封」，於是至元十九年（1282）十一月，元世祖忽必烈召孔洙赴闕，決定讓孔洙「載封歸魯奉祀」。孔洙奉詔北上大都覲見忽必烈，以孔氏南宗歷代衍聖公的墳墓均在衢州，難以離棄，且曲阜子孫守護林廟有功于祖，遂主動讓出襲封衍聖公世爵。自此，因時局動盪、高宗南渡而遷於衢州的孔氏大宗複歸於曲阜。忽必烈對孔洙大加讚賞，遂命其為國子監祭酒、承務郎兼提舉浙東學校事。至元二十八年（1291），孔洙去世，葬於衢州。自孔端友扈蹕南渡，衍聖公在衢州傳承六世，至孔洙去世近一百六十年。

   孔氏南宗自五十三代孔洙之後，直至民國改爵為官，其傳承為：五十四代思許、五十五代克忠、五十六代希輅、五十七代儀、五十八代公誠、五十九代彥繩（明正德元年六月十一日，受封翰林院五經博士。孔氏南宗由此複爵）、六十代承美、六十一代弘章、六十二代聞音、六十三代貞運、六十四代尚幹、六十五代衍禎、六十六代興燫、六十七代毓垣、六十八代傳錦、六十九代繼濤、七十代廣杓、七十一代昭烜、七十二代憲坤、七十三代慶儀。

   南宗失去爵位後，日趨衰微。至明代中期，「三衢家廟，缺官奉祀」，南宗後裔，「猥同氓庶」。衢州知府沈傑以明代尊孔崇儒之精神，擬就《衢州知府沈傑為條陳孔氏家規以彰聖教》及《乞添授衢州孔氏官職及處置祀田疏》，於弘治十八年（1505）上奏孝宗，請求「敕命吏、禮二部詳定禮制，合無將衢州孔端友嫡派子孫添授以五經博士一員，以主祭祀，責令灑掃家廟，看守各代聖公墳塋，統領見存子孫。仍乞將本戶舊賜田畝照依原稅數目，每歲依期上納本府官倉或儒學倉。按月支給與米二石，以供灑掃祭奠。」同時，乞請減免舊賜祭田賦稅，「如此，則家廟不至於墮廢，祭田不至於變賣，子孫不至於流移，聖裔不至於湮沒。」孝宗准其所奏，但卻旋即駕崩，遺敕於後。明武宗繼位後，于正德元年（1506），詔授南宗孔子第五十九代孫孔彥繩為翰林院五經博士，子孫世襲，並減免祭田賦稅，奉衢州廟祀。自此，中斷225年之久的南宗襲封得以恢復。

   同時，朝廷再次明確衍聖公為全族宗主，南宗的爵位享受衍聖公次子待遇，與顏、曾、孟三氏翰博相同，官秩正八品，代衍聖公管理衢州族務，且與他氏聖裔翰博一樣，均受衍聖公之節制。現存南宗《衢州孔氏家規》也正是明正德初年欽准刊行，共分七條。其《遵制典》條雲：「竊恐後世兩派子孫互相嫌隙，妄起爭端，不惟有違聖朝制度盛典，又恐背忘伊祖德讓之風，合無嚴立規戒，行令在衢子孫永遵制典，恪守祖風、有違者以不忠不孝論，置之重典，永不敘錄。」其《責報本》條又規定：「今後其南渡孔氏子孫，每十年一赴闕裡，謁拜聖祖家廟，祭掃山林，一展本末水源時思之敬。就令會同南北宗譜，開保歷代子孫名諱，居曲阜縣者書引于前，居衢州府者書引於後，庶俾流裔清白，不致泮渙分離。」孔氏大宗主衍聖公對衢州翰林博士擁有絕對管轄權，衢州翰林博士必須隨時將情況報明衍聖公府。清代對世襲翰林院五經博士再次申明嚴格規定，翰博之承襲，將應襲者的親供與裡鄰、親族甘結，附上應襲者三代履歷由西安縣逐級轉呈，經衍聖公批示，方可呈請吏部、禮部選任。吏、禮二部批准後，經予文憑，諮文衍聖公府，轉發至翰林公署。衢州翰林博士接到文憑後必須在規定期限內到任，延期不得超過一個月，並將到任時間上報衍聖公府，以轉報吏、禮二部。民國二年（1913），北洋政府頒佈《崇聖典例》，在這份《崇聖典例》裡，把聖裔分成「世爵」（衍聖公）和「世職」（翰博）兩類：「第一條、衍聖公膺受前代榮典，均仍其舊。其公爵按舊制由宗子世襲，報經地方行政長官呈由內務部核請承襲。……第四條、聖賢後裔舊有五經博士等世職，茲均改為奉祀官，世襲，主祀；其舊設奉祀生裁撤之。奉祀官按舊設額置。」北洋政府在當時保留了衍聖公孔令貽世爵之位，而當時的改衢州世襲五經博士孔慶儀為世職「大成至聖先師南宗奉祀官」。同時，奉祀官的承襲也須由衍聖公諮文「地方行政長官呈明內務部核准」，承襲過程中仍需族長、各支房長及鄰右出具甘結，附上應襲者三代履歷相關宗圖，印花稅洋一圓，付衍聖公府掌書廳監印等手續費30圓，一併呈衍聖公府，再由衍聖公府將相關檔及印花稅交由山東省長轉呈內務部。待內務部批准後，發給任命執照，經山東省長交衍聖公府，再劄付南宗奉祀官收悉。

   孔湞，字昭度。孔元措之弟元紘之孫，父孔之固。孔元措無子，便以族孫孔湞繼嗣。孔湞為側室所出，在其父孔之固去世後，母子二人遭到其嫡母的欺淩和驅逐，其生母被嫡母任氏強迫嫁給蒙古驅口（奴隸）李氏，因以為姓。孔湞的伯祖父孔元措後來獲悉此事，就把孔湞尋回，養育為嗣孫。但孔元措此舉卻引起其女婿李天輔的不滿，在元朝添造戶籍時，李天輔將孔湞的戶口填報在驅口李氏名下，而此事孔元措卻並不知情，這就為後來孔湞被罷爵埋下了伏筆。孔湞在孔元措去世後的第二年、即元憲宗元年（1251）襲封衍聖公。孔湞幼失怙持，教育不力，襲爵後喜歡校獵之事，日事鷹犬，更有甚者直接不修祖祀，這就引起了孔氏族人的強烈不滿。以孔之全之子孔治為首的族人遂對孔湞進行了指責和攻訐，訟告他不事儒雅，且為驅口賤民李氏之後，並已名列驅口戶籍，實非聖人子孫。

   事起，查對戶籍，果然在冊，遂于元憲宗二年（1252）被虢奪封爵。孔湞被奪爵後，終元世祖忽必烈之世、其間又雖經孔洙之讓爵，但實際上元政府卻並沒有另選他人承襲封爵，於是遂造成了孔氏世爵中斷四十三年之久，也造成中國歷史上一個絕無僅有的時期，就是在這四十三年的時間內，天下儒門無宗。等到這個問題的解決，則要到元成宗元貞元年（1295），才由孔治襲封衍聖公。

   孔湞被奪爵後，其嫡母任氏方「悔之」，《闕裡志·表章》記載了當時任氏上《辨正孔湞表》，稱孔湞「乃五十一代襲封衍聖公孔元措之耳孫，五十二代襲封衍聖公孔之固之塚嗣」，「雖雲庶出，實系長房」，冀望對孔湞複爵，但已為時已晚，元憲宗蒙哥的奪爵命令早已發出。後來，孔湞被改任為知濰州（今山東濰坊）。

   孔湞乏嗣。

   孔治，字世安，孔元用之孫、孔之全之子。金宣宗貞佑時期，孔元措受命赴汴京，囑元用代守林廟祀事。後來蒙古太祖十三年（1218）任命孔元用為曲阜縣尹，二十一年又命孔元用帶兵隨軍攻打益都，以其子孔之全代攝祀事兼曲阜縣尹。元太宗五年（1233）蒙古軍攻克汴京，命孔元措回曲阜奉祀林廟，孔元措因孔之全父子守護林廟有功，遂將曲阜縣尹讓與孔之全，從此以後衍聖公不再兼任此職。

   孔治于元憲宗二年（1252）充任曲阜管民長官，是年十二月，衍聖公孔湞被詔奪爵。元世祖中統元年（1260）三月，忽必烈即汗位，夏五月仍命孔治襲世職曲阜縣尹，並權攝祀事。孔治在權奉廟祀期間，元政府已罷免了闕裡林廟灑掃戶，祭祀也無公帑，每逢祀期，孔治則自出財力以備祭祀，「凡朝廷大祭，維豐維潔，咸備於己。」至元四年（1267），孔治「不忍廟貌殘缺」，「權祀之職，匪事功何以塞繼述之責」，遂上奏請求修廟，元世祖撥白金五十兩，敕令修闕裡孔子廟，同時並定首領官朔望謁孔子廟之禮。但此次修繕，僅創環廊，易木柱為石柱，重修廟牆、杏壇、齋廳、學校等，「即其舊而新之，禮殿則未遑也」。（元閻複《重建至聖文宣王廟碑》）

   孔治在任期間勤於政務，頗具官聲，《闕裡文獻考》載其「宰曲阜二十餘年，內撫百姓，外給軍旅，才幹著聞」。元憲宗至元八年（1271），定國號大元，十三年（1276）授孔治承事郎。二十二年（1285），授孔治奉訓大夫，升單州（今山東曹縣東）防禦使，並令其子思誠就任世襲曲阜縣尹。孔治赴任單州防禦史行前誡其子曰：「毋妄怒，輕笞人。邑長者見如父兄，幼者撫若子弟。毋負乃父訓。」到任後興建學校，延聘名師，以成士風。至元二十防禦史九年（1292），遷為奉直大夫，知密州（今山東諸城），又首創儒學三皇廟，「正彝倫，明禮法，建醫學，濟斯民，扶仁壽」。

   據孔治神道碑碑文記載，元成宗元貞元年（1295），孔治赴闕朝賀鐵穆耳即位，「元貞改元，公見成宗皇帝于上都，時大臣奏：『至聖文宣王孔夫子之嫡孫，其祖元用以軍功沒于王事，實開國立功之臣。治權奉祀事三十餘年，有德有文，可襲封爵。』上可其奏，仍賜坐，慰勞甚厚，特授中議大夫、衍聖公。」元成宗並應孔治之請，賜廟田五十頃，複給林廟灑掃戶，重修闕裡孔廟。至此，中斷了四十三年之久的孔氏世爵衍聖公終於恢復。孔治《神道碑》記載，受封後孔治感荷祖蔭，「作堂私第，名以詩禮，亦不忘過庭之教。」

   元成宗大德四年（1300），給衍聖公孔治隨朝四品官俸。大德十一年（1307）十一月九日，孔治去世，享年七十一歲，葬于祖墓之西。子一孔思誠，襲封衍聖公，後罷爵。

第五十四代：孔思誠、孔思晦（1267-1333）

   孔思誠，字致道。孔治之子。元世祖至元二十二年（1285），孔治出任單州防禦使，孔思誠接替其父就任曲阜縣尹。元成宗大德五年（1301）升任國子監丞，大德十一年（1307）孔治去世，孔思誠襲封衍聖公。

   孔思誠襲封之際，正值元成宗鐵穆耳駕崩、元武宗海山即位之時。大德十一年春正月，元成宗鐵穆耳崩，海山即位後即於大德十一年秋七月辛巳，加封至聖文宣王為「大成至聖文宣王」。有元諸帝，武宗海山雖然在位僅四年，但其尊儒崇道則勝於前朝。武宗至大元年（1308），遣集賢學士王德淵齋銀幣來祭告于闕裡。二年（1309），制春秋二丁釋奠牲用太牢，置曲阜孔廟奎文閣典籍官一員。三年冬十月，運登歌樂器于闕裡孔子廟。四年閏七月，又遣國子監祭酒劉賡齋銀幣雜采彩來祭告孔子廟。元仁宗延佑元年（1314）敕議當襲衍聖公者以名聞，三年夏六月，罷孔思誠以孔思晦為中議大夫、襲封衍聖公，孔思誠最後則以朝列大夫的身份出任濮州（今山東鄄城北）尹。

   孔思誠為孔元用之後，不屬嫡裔，所以他以庶支承爵，為族人所難服，根據文獻記載來看，當時孔氏族人曾數次上疏請立正嫡，終至元仁宗延佑三年（1316）重立孔思晦襲爵，孔氏大宗遂複歸於正。此事在《元史·元明善本傳》中也有記載，但時間和世次均有誤：延佑二年「改禮部尚書，正孔氏宗法，以宣聖五十五世孫孔思晦襲封衍聖公，事上，制可之。」

   孔思誠三子：孔克欽、孔克純、孔克容。其中孔克欽襲曲阜縣尹。

   孔思晦，字明道，孔子第五十四代嫡孫。孔繼汾在《闕裡文獻考·世系》中詳細述及孔氏大宗世系時說：

   南北二宗衍聖公皆四十六代宗願之裔也。宗願長子若蒙生端友、端操，端友無子，以端操幼子玠嗣，至洙六世是為南宗，自洙無嗣而南宗者絕。北宗端操生璠、瑱：璠生拯、摠、摶，摠生元措、元紘，元紘生之固，之固生湞。摶生元泰、元讓；瑱生括，括生元衡。

   宗願次子若虛生端本，端本生璋，璋生抃、挺，抃生元隆，挺生元錫。

   宗願第三子若愚生端稟、端立，端稟生珵，端立生琥，琥生拂，拂生元直、元孝、元用。元孝生之厚，之厚生浣。

   自浣以上若拯、元措、湞、元泰、元讓、元衡、元隆、珵、元直皆無嗣，惟浣有子思晦，以次相推最為宗長。當端友之隨宋南渡也，弟端操權主祀事，其後璠、拯、摠、元措、湞皆循次繼立。自湞之失爵，元人在兵戈擾攘間未暇講求所當立者，輒以元用有軍功死王事，封其孫治，治又傳子思誠，非立嗣法也。故大宗之統歸於思晦始為得其正雲。

   孔思晦是第四十六代孔宗願之後，其高祖孔拂有三子，除長子孔元直乏嗣外，次子就是孔思晦的曾祖孔元孝，三子則是孔思誠的曾祖孔元用。孔元孝生孔之厚，之厚贈亞中大夫、濟甯路總管、輕車都尉、魯郡侯。孔之厚之子孔浣，字日新，贈通議大夫，禮部尚書、輕車都尉、魯郡侯。孔思晦就是孔浣之子。

   孔思晦生於至元四年（1267）四月，自幼天資聰穎，讀書能通大義，曾受業於三氏學教授張須，因家裡貧窮，常親自下地耕種，但也沒有因此而耽誤學習，所以深得三氏學老師的器重。在孔思晦十七歲時，其父孔浣去世。大德七年（1303）孔思晦曾遊學京師，深受國子監祭酒耶律有尚的青睞，準備推薦其出仕做官，孔思晦以母親年邁無人照料為由，謝絕了耶律有尚的好意。至大三年（1310）孔思晦因孝聞名，被三氏學教授推舉茂才，被授範縣儒學教諭，元仁宗延佑二年又調任甯陽縣學。而當時這兩地的前任學官，多以俸祿少無法養家而放棄該職務，孔思晦到任後則「教養有法」，乃至其離任時「比代皆挽留，不忍舍」。延佑三年（1316）孔氏族人合議以孔思誠本系庶支不當承爵，上書請免孔思誠而授思晦，元仁宗經過詢問並親查孔氏譜牒後，罷免孔思誠，孔思晦於是年夏六月襲封孔氏世爵衍聖公。延佑五年（1318）春正月孔思晦置孔廟雅樂，六年，制三氏學官聽衍聖公遴補，並置孔廟司樂官。元泰定帝泰定三年（1326），山東廉訪副使王鵬南上言，衍聖公襲爵上公，秩僅正四品，與格不稱，請求提高衍聖公品秩，元帝遂於第二年加授孔思晦嘉議大夫。元文宗天曆二年（1329）頒給衍聖公四品銅印。元甯宗至順元年（1330），孔思晦上書以孔子封「王」，其父則為「公」爵，於禮不合，請對孔子父母優加褒崇。元帝懿璘質班准其所請，秋閏七月降旨加封孔子之父叔梁紇為「啟聖王」，母顏氏為「啟聖王太夫人」。二年（1331）秋七月，從歐陽玄建言，頒給衍聖公三品銀印。三年（1332）春正月，上亓官夫人號曰「大成至聖文宣王夫人」。

   金元之時，闕裡聖廟多毀於兵燹，雖屢有修葺，但制度未備。有元一代，闕裡孔廟修葺者共十三次，而「廟庭規制悉複」與孔氏之興，實則孔思晦之功。元文宗天曆二年（1329），因孔思晦所請，「聖廟歲久漸壞，敕濟甯路出官錢五萬二千餘緡修葺。」至順二年（<span style="font-size:14px;font-family:'微软雅黑',sans-ser